Protein–RNA interactions for Protein: P29973

CNGA1, cGMP-gated cation channel alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 690 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA1P29973 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AGER-203ENST00000375065 665 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CRISPLD2-210ENST00000569090 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZNF347-208ENST00000601804 496 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LINC00623-205ENST00000621058 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CNGA1P29973 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms