Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TRPV4-201ENST00000261740 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CASP1P29466 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms