Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DEGS1-201ENST00000323699 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PARN-202ENST00000420015 2360 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CRLS1-203ENST00000452938 3859 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PSMB4P28070 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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