Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

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Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
CHMP24386 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 HNRNPH3-202ENST00000354695 1332 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
CHMP24386 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHMP24386 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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CHMP24386 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
CHMP24386 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
CHMP24386 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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