Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
HRCP23327 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 PRKN-204ENST00000366896 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
HRCP23327 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 WDR27-201ENST00000423258 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
HRCP23327 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 PLEKHO2-202ENST00000616065 3569 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HRCP23327 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 AL359183.1-201ENST00000623796 2132 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 MYD88-203ENST00000417037 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 WDR77-201ENST00000235090 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HRCP23327 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms