Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 DBNDD2-207ENST00000372722 1202 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 AL121949.3-201ENST00000406684 385 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 NDUFC1-209ENST00000539002 1198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 NDUFC1-211ENST00000544855 1257 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 SNRPF-205ENST00000553192 552 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC068831.5-201ENST00000557387 328 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TRHP20396 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 RPL9-203ENST00000449470 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC066613.1-202ENST00000560727 630 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 HLA-DQB1-202ENST00000399079 1501 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TRHP20396 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 SPATS1-202ENST00000323108 1107 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 AHCYP3-201ENST00000420053 1279 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 PGAP2-207ENST00000463452 931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 C11orf58-207ENST00000525684 575 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 C11orf58-209ENST00000528634 776 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 C12orf73-204ENST00000546819 582 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC005759.1-202ENST00000599416 415 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 AL031670.1-201ENST00000619343 669 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TRHP20396 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 IGLV9-49-201ENST00000427632 409 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 KRT8P30-201ENST00000432100 650 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 RN7SL69P-201ENST00000468423 272 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TRHP20396 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms