Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 ZNF746-201ENST00000340622 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
SDSP20132 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 CMPK1-203ENST00000371873 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
SDSP20132 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SDSP20132 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SDSP20132 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDSP20132 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDSP20132 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDSP20132 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SDSP20132 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms