Protein–RNA interactions for Protein: P15498

VAV1, Proto-oncogene vav, humanhuman

Predictions only

Length 845 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAV1P15498 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
VAV1P15498 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 MRPL13-201ENST00000306185 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TRIM17-205ENST00000456946 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
VAV1P15498 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms