Protein–RNA interactions for Protein: P12036

NEFH, Neurofilament heavy polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFHP12036 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MBTD1-204ENST00000586178 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NPHP3-ACAD11-201ENST00000471702 7784 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GLIS3-201ENST00000324333 6667 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ADCYAP1R1-201ENST00000304166 6487 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 HYAL2-201ENST00000357750 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 OR2C3-204ENST00000641802 8509 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 EML5-207ENST00000554922 9570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 FHOD3-201ENST00000257209 4967 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SMC5-201ENST00000361138 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 POU2F2-202ENST00000389341 6901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NEFHP12036 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms