Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 OSCP1-204ENST00000433045 1381 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PDE6G-201ENST00000331056 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC073352.2-201ENST00000609385 439 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 Metazoa_SRP.65-201ENST00000615602 264 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC090515.2-201ENST00000500929 1396 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 MRPL23-204ENST00000397297 613 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC004923.1-202ENST00000642106 209 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AL157791.1-201ENST00000553667 1699 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 IL9-201ENST00000274520 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 GLYCTK-204ENST00000471180 992 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SMIM23-202ENST00000523047 573 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 RTN3P1-201ENST00000536295 711 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SCML4-201ENST00000369020 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PLA1A-205ENST00000494440 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
C4BP0C0L5 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms