Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 PRG2-201ENST00000311862 1424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 HHIP-AS1-201ENST00000503066 897 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CSTF3-206ENST00000524827 693 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 LRWD1-209ENST00000626402 138 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ODF4-201ENST00000328248 1156 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
POLR1AO95602 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TMEM91-211ENST00000544232 725 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 IDI2-AS1-201ENST00000420381 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 LINC01352-201ENST00000431347 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLR1AO95602 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms