Protein–RNA interactions for Protein: O75665

OFD1, Oral-facial-digital syndrome 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,012 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OFD1O75665 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
OFD1O75665 PLA2G4B-202ENST00000458483 2734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
OFD1O75665 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OFD1O75665 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OFD1O75665 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 MAPT-204ENST00000344290 6816 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 CICP20-201ENST00000443330 2801 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 COL6A2-202ENST00000310645 3446 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
OFD1O75665 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
OFD1O75665 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.5 ms