Protein–RNA interactions for Protein: O43868

SLC28A2, Sodium/nucleoside cotransporter 2, humanhuman

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Length 658 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC28A2O43868 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 PLA2G5-201ENST00000375108 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SLC28A2O43868 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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