Protein–RNA interactions for Protein: B3KS81

SRRM5, Serine/arginine repetitive matrix protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRRM5B3KS81 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LITAF-218ENST00000576036 603 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SNRPN-201ENST00000346403 1304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SRRM5B3KS81 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms