Protein–RNA interactions for Protein: A4UGR9

XIRP2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 3,374 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XIRP2A4UGR9 TPD52L1-208ENST00000528193 789 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SOD2-202ENST00000367054 815 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 Metazoa_SRP.100-201ENST00000447610 282 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 FABP5P3-202ENST00000477993 1027 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TTPAL-203ENST00000372906 1139 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 IL1R2-203ENST00000441002 1106 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RBM8B-201ENST00000555532 525 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SEC13-208ENST00000397109 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC005726.2-204ENST00000577790 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RNF146-211ENST00000609447 607 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 OR2K2-202ENST00000374428 1038 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RCC2P8-201ENST00000502779 1035 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 FAM104A-206ENST00000583024 417 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 HFE-203ENST00000336625 804 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 Z97652.1-201ENST00000415176 329 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 LINC01433-201ENST00000419003 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
XIRP2A4UGR9 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
XIRP2A4UGR9 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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