Protein–RNA interactions for Protein: A3KMH1

VWA8, von Willebrand factor A domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VWA8A3KMH1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FGFR1OP-201ENST00000349556 1484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 C12orf49-204ENST00000548356 923 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
VWA8A3KMH1 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 IGHJ2P-201ENST00000454480 60 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 KRT8P13-201ENST00000463294 1010 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 ALG1L2-201ENST00000425059 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
VWA8A3KMH1 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms