Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC004834.1-201ENST00000640784 2412 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NR3C1-203ENST00000394464 6795 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 PARP10-201ENST00000313028 3497 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC78A2IDD5 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms