Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPW6

SATB2, DNA-binding protein SATB2, humanhuman

Predictions only

Length 733 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SATB2Q9UPW6 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RREB1-202ENST00000349384 7440 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 RNF216P1-213ENST00000494947 946 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SATB2Q9UPW6 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.3 ms