Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNY4

TTF2, Transcription termination factor 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF2Q9UNY4 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CD74-212ENST00000524315 584 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RN7SL560P-201ENST00000577943 264 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TTF2Q9UNY4 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.6 ms