Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PRKXP1-201ENST00000561423 1122 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LINC00969-254ENST00000625358 962 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 GSDMA-203ENST00000635792 1546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NDUFB8-201ENST00000299166 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AL450469.2-201ENST00000427132 499 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ZNRF3Q9ULT6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms