Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC242376.2-201ENST00000619355 883 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 HLA-K-203ENST00000430151 1046 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AL031282.1-201ENST00000577672 409 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 AC111170.1-201ENST00000591110 1132 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 PRMT5-AS1-206ENST00000599580 847 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 MIR6842-201ENST00000612539 65 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
KDM5BQ9UGL1 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC069277.1-202ENST00000414438 761 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TBC1D3J-201ENST00000620719 1426 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 RPAIN-201ENST00000327154 815 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 LINC00461-207ENST00000506978 564 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TMEM218-205ENST00000527271 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC090857.1-201ENST00000527400 390 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 LINC01481-204ENST00000550216 494 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
KDM5BQ9UGL1 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms