Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB9

TFIP11, Tuftelin-interacting protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFIP11Q9UBB9 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 CROCC-201ENST00000375541 6656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 HEPN1-201ENST00000408930 1434 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TFIP11Q9UBB9 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TFIP11Q9UBB9 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms