Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP77

SSU72, RNA polymerase II subunit A C-terminal domain phosphatase SSU72, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSU72Q9NP77 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SV2A-201ENST00000369145 2903 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 HDAC2-206ENST00000519108 2000 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC005840.4-201ENST00000541242 2494 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 ABR-228ENST00000574437 3196 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SSU72Q9NP77 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.4 ms