Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC16

APOBEC3G, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3G, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3GQ9HC16 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SH2D6-202ENST00000389938 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CTSD-207ENST00000636571 1790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
APOBEC3GQ9HC16 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms