Protein–RNA interactions for Protein: Q9HB65

ELL3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3Q9HB65 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SMIM5-201ENST00000375215 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 KLHL21-201ENST00000377658 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 STRC-205ENST00000450892 5680 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AP001282.1-201ENST00000531301 1499 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 FAM30A-205ENST00000630242 9612 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TMX4-201ENST00000246024 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GMPPB-203ENST00000480687 6108 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 THBS2-201ENST00000366787 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 FEM1A-201ENST00000269856 9593 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NUP153-203ENST00000613258 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 CEP126-201ENST00000263468 7039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NUDT3-201ENST00000607016 9905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 ARAP3-201ENST00000239440 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 NUP160-201ENST00000378460 5376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 USP9X-202ENST00000378308 8371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
ELL3Q9HB65 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
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