Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY84

DUSP16, Dual specificity protein phosphatase 16, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP16Q9BY84 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 STYXL1-203ENST00000359697 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
DUSP16Q9BY84 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 RPSAP31-202ENST00000445165 716 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 SHOX2-202ENST00000425436 1513 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
DUSP16Q9BY84 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms