Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 UBE3A-207ENST00000614096 8741 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 IDH3B-201ENST00000380843 1545 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ZNF789-211ENST00000493485 556 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
H2AFJQ9BTM1 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms