Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW7

SYT17, Synaptotagmin-17, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT17Q9BSW7 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT17Q9BSW7 EMP1-211ENST00000544053 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT17Q9BSW7 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT17Q9BSW7 ATP6AP2-226ENST00000637526 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT17Q9BSW7 KRT18P9-201ENST00000604826 1300 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
SYT17Q9BSW7 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 HIST1H2AE-201ENST00000303910 509 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 GSTP1-201ENST00000398603 700 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 VCX3A-202ENST00000398729 808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC105254.1-201ENST00000507782 621 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 C16orf45-209ENST00000566490 1854 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 LIF-202ENST00000403987 592 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 FTH1P22-201ENST00000456305 520 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 TMEM98-205ENST00000578289 806 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
SYT17Q9BSW7 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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