Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

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Length 1,192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PKP4Q99569 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 RAD51D-218ENST00000590016 1528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 MRPL49-201ENST00000279242 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
PKP4Q99569 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
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