Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PCNA-202ENST00000379160 1359 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 OARD1-203ENST00000463088 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 TREX1-202ENST00000444177 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AC245884.1-201ENST00000457113 529 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 HPGD-203ENST00000422112 805 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 SLC12A5-216ENST00000626701 617 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ALPK3Q96L96 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms