Protein–RNA interactions for Protein: Q969W0

SPTSSA, Serine palmitoyltransferase small subunit A, humanhuman

Predictions only

Length 71 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTSSAQ969W0 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
SPTSSAQ969W0 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SGSH-203ENST00000570923 1546 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CD93-201ENST00000246006 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
SPTSSAQ969W0 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms