Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TUBB3P1-201ENST00000405796 1332 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
GTF3C6Q969F1 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms