Protein–RNA interactions for Protein: Q92542

NCSTN, Nicastrin, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCSTNQ92542 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 WNT16-201ENST00000222462 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
NCSTNQ92542 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms