Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C7

RNF148, RING finger protein 148, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF148Q8N7C7 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ITGAV-201ENST00000261023 7030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 KRT27-201ENST00000301656 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 PRKD2-202ENST00000433867 3321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 TDRD5-204ENST00000444136 3946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
RNF148Q8N7C7 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 GIPC2-201ENST00000370759 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 ATP6V1H-201ENST00000355221 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 PPM1F-201ENST00000263212 5143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 MIRLET7BHG-203ENST00000435439 2264 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF148Q8N7C7 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.9 ms