Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTX7

CATSPER4, Cation channel sperm-associated protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CATSPER4Q7RTX7 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DSCR3-202ENST00000398998 988 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DEPDC7-202ENST00000311388 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CATSPER4Q7RTX7 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms