Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 GAP43-202ENST00000393780 1901 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
LINC00299Q6ZSB3 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LINC00299Q6ZSB3 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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LINC00299Q6ZSB3 RNF220-203ENST00000361799 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
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LINC00299Q6ZSB3 RNF220-204ENST00000372247 3010 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
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LINC00299Q6ZSB3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LINC00299Q6ZSB3 LPO-201ENST00000262290 2979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CEP131-202ENST00000374782 3505 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
LINC00299Q6ZSB3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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LINC00299Q6ZSB3 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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