Protein–RNA interactions for Protein: Q5VT33

LINC01545, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01545, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01545Q5VT33 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 KCNH4-201ENST00000264661 3920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MX1-202ENST00000398598 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TANK-202ENST00000392749 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PPP6R2-203ENST00000395741 3304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AMPD2-219ENST00000528667 3134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MOGAT3-201ENST00000223114 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PNMA1-201ENST00000316836 2590 ntAPPRIS P1 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 KIRREL3-205ENST00000529097 3397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 HFE-202ENST00000317896 1922 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GPR4-201ENST00000323040 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PAX6-276ENST00000640684 1557 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC114271.1-201ENST00000612689 2813 ntBASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 FRMD8-201ENST00000317568 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ATP5J2-PTCD1-201ENST00000413834 2491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ACADM-202ENST00000370841 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CPT1C-202ENST00000323446 2783 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 KDM8-212ENST00000568965 1655 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 TPM3-206ENST00000330188 2108 ntTSL 1 (best) BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.14□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 SLC35C2-203ENST00000372227 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 BEND7-201ENST00000341083 2239 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 RBFADN-204ENST00000568911 5187 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 COG5-202ENST00000347053 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 OFD1-202ENST00000380550 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.13□□□□□ -0.63
LINC01545Q5VT33 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms