Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRE7

PHYHD1, Phytanoyl-CoA dioxygenase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHYHD1Q5SRE7 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL606760.1-201ENST00000458151 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PHYHD1Q5SRE7 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms