Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWE3

PRRT3, Proline-rich transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 981 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRT3Q5FWE3 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
PRRT3Q5FWE3 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 C17orf74-201ENST00000333870 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 FLT3LG-201ENST00000204637 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AC135178.3-201ENST00000583963 531 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PRRT3Q5FWE3 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.6 ms