Protein–RNA interactions for Protein: Q504Y0

SLC39A12, Zinc transporter ZIP12, humanhuman

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC39A12Q504Y0 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SUN2-203ENST00000406622 2725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SUN1-204ENST00000403868 978 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC127383.1-201ENST00000444697 1800 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SLC39A12Q504Y0 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AL929472.3-201ENST00000433474 700 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SLC39A12Q504Y0 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 261.8 ms