Protein–RNA interactions for Protein: Q3B7T1

EDRF1, Erythroid differentiation-related factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDRF1Q3B7T1 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
EDRF1Q3B7T1 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AGAP7P-201ENST00000582299 2062 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AGAP14-201ENST00000624701 2060 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
EDRF1Q3B7T1 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms