Protein–RNA interactions for Protein: Q17RM4

CCDC142, Coiled-coil domain-containing protein 142, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC142Q17RM4 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 BRF1-203ENST00000379937 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC144831.1-201ENST00000573312 2656 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CDPF1-204ENST00000404744 1541 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PXN-AS1-204ENST00000542265 854 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FAM151A-201ENST00000302250 2005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 FADS2-210ENST00000522056 1689 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC142Q17RM4 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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