Protein–RNA interactions for Protein: Q16878

CDO1, Cysteine dioxygenase type 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDO1Q16878 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TBC1D22A-205ENST00000406733 2267 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KRT18P64-201ENST00000434946 1219 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC084121.3-201ENST00000641716 218 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 BABAM1-201ENST00000359435 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CYMP-203ENST00000474680 1263 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 SEC63-201ENST00000369002 6411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CDO1Q16878 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CDO1Q16878 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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