Protein–RNA interactions for Protein: Q16549

PCSK7, Proprotein convertase subtilisin/kexin type 7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK7Q16549 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 PTGES3L-AARSD1-201ENST00000360221 1790 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 HIST2H3PS2-201ENST00000392948 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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PCSK7Q16549 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 EFNA4-201ENST00000359751 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 ORC5-208ENST00000626700 344 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
PCSK7Q16549 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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