Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ADIG-204ENST00000537425 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 COX6A1P2-201ENST00000620597 330 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 WDR54-201ENST00000348227 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 NOC2LP1-201ENST00000450578 752 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ANKRD11-208ENST00000563291 593 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 COL9A1-204ENST00000370496 1372 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RHOXF1-201ENST00000217999 769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 MRPS22-201ENST00000310776 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SSR4-203ENST00000370086 643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 RN7SL181P-201ENST00000462921 277 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 IGLV3-15-201ENST00000518356 244 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CCDC197-205ENST00000636493 1279 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 SLC41A3-211ENST00000508835 1480 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
DDB1Q16531 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
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