Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RNF167-211ENST00000575111 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CENPM-205ENST00000404067 905 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 VPS26A-201ENST00000263559 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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ZNHIT3Q15649 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNHIT3Q15649 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNHIT3Q15649 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNHIT3Q15649 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNHIT3Q15649 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNHIT3Q15649 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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ZNHIT3Q15649 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNHIT3Q15649 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 2270.9 ms