Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

Predictions only

Length 1,050 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TJAP1-207ENST00000436109 2572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FAM192A-201ENST00000309137 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CORO6-201ENST00000345068 2603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
HERC3Q15034 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms