Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SULT1A1-211ENST00000569554 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PLEKHO2-201ENST00000323544 3720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 HMGB3P14-201ENST00000494195 599 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AL353729.2-201ENST00000605859 1249 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LAPTM4AQ15012 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LAPTM4AQ15012 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AP002856.3-201ENST00000441665 635 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 HADH-212ENST00000638621 741 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LAPTM4AQ15012 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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