Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CXCL6-201ENST00000226317 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ANO10-213ENST00000451430 2019 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 ECE1-204ENST00000415912 5099 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
PCLAFQ15004 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms