Protein–RNA interactions for Protein: Q149M9

NWD1, NACHT domain- and WD repeat-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,564 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NWD1Q149M9 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 CDPF1-203ENST00000404583 1439 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
NWD1Q149M9 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AL356056.1-201ENST00000437899 369 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AC004869.1-201ENST00000440935 540 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 SLC27A5-204ENST00000594786 643 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AP000356.3-201ENST00000382243 753 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 C15orf59-AS1-202ENST00000615095 1224 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
NWD1Q149M9 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms